История Православия в г. Раздельная началась в 1901 году, когда по распоряжению императора Николая II была основана Церковь Николая Чудотворца.
Фонды на строительство выделяла железная дорога. Николай Чудотворец - покровитель путешественников.
Раздельная же в начале ХХ века становится железнодорожной станцией 1 - й категории, в связи с этим имя церкви дано неслучайно.
Как впрочем и местоположение: у вокзала, что позволяет всегда быть в центре общественной жизни. Была при церкви и приходская школа.
Настоятелем церкви в это время был Романович Ипполит Николаевич, который был предоставлен, вниманием самого императора Николая II.
В 1904 году Николай II с женой Александрой Федоровной прибыл в Раздельную и посетил Свято - Николаевскую церковь, где наградил именными золотыми часами священника отца Ипполита, за усердие.
В 1911 году император Николай II во второй раз посетил Раздельнянскую церковь, но уже вместе со своим сыном, наследником престола царевичем Алексеем.
В начале 20 - х годов настоятель церкви отец Ипполит умирает от тифа, в возрасте 44 лет. Могила отца Ипполита находится в церковном дворе.
После его смерти церковь была закрыта на долгие годы. Во время оккупации церковь открыли, однако прежнего внешнего величия она лишилась, в связи с повреждением статей.
Действовала она в начале 50 - х годов и вновь была закрыта до 90 - х годов ХХ века.
И только в 1990 году началось восстановление церкви, которое проходило поэтапно, в течение 6 лет.
14 января 1991 было проведено первое богослужение и с тех пор, несмотря на восстановительные (даже внутренние) работы, проводились литургии.
В 1997 году, 5 октября, церковь была полностью восстановлена и освящена Агафангелом, Митрополитом Одесским и Измаильским.
Вместе с восстановлением церкви был образован и Орган Раздельнянского Благочинья. Первым Благочинным округа был протоиерей Александр Ткаченко. В 1991 г. Благочинным был священник Сергий Задворный.
С 21 июля 1992 года по 28 января 2015 года Благочинным являлся Петр Акимович Дутчак. В 1992 г. Благочиние состояло из 4 – х районов: Раздельнянского, Ивановского, Березовского и Коминтерновского и имело 16 приходов.
В 2000 г. Раздельнянское Благочиние насчитывало уже 65 приходов. В этом же году Благочиние было разделено, в его составе осталось только два района - Ивановский и Раздельнянский и состояло из 24 приходов.
После выделения Ивановского Благочиния в 2013 году Раздельнянское Благочиние объединяет 24 прихода Раздельнянского района. С февраля 2015 года Настоятелем Свято-Николаевского храма и Благочинным храмов Раздельнянского округа стал Вячеслав Владимирович Ткаченко.